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http://hdl.handle.net/11612/7609| Autor(a): | Sousa, Gizela Maria de Araujo |
| Orientador: | Ságio, Solange Aparecida |
| Título: | Análise comparativa de métodos de extração visando a obtenção de RNA de qualidade na cultura da mandioca |
| Palavras-chave: | Transcriptoma; Expressão gênica; RT-qPCR; Manihot esculenta; Transcriptome; Gene expression; RT-qPCR; Bioethanol Manihot esculenta |
| Data do documento: | 10-Abr-2025 |
| Editor: | Universidade Federal do Tocantins |
| Programa: | Programa de Pós-Graduação em Agroenergia - PPGA |
| Citação: | SOUSA, Gizela Maria de Araujo. Análise comparativa de métodos de extração visando a obtenção de RNA de qualidade na cultura da mandioca.2025.67. Dissertação (Mestrado em Agroenergia) – Universidade Federal do Tocantins, Programa de Pós-Graduação em Agroenergia, Palmas, 2025. |
| Resumo: | A mandioca (Manihot esculenta Crantz) é considerada como uma das principais culturas agrícolas, não apenas em território brasileiro, como também em diversos outros países. Para entender os processos moleculares que regulam o desenvolvimento e a resistência da mandioca a doenças, por exemplo, é essencial o uso de ferramentas moleculares avançadas. A extração de RNA é uma etapa fundamental em estudos moleculares. Entretanto, o processo de extração é complexo e requer cuidados para evitar a degradação do RNA e assegurar a pureza da amostra. O objetivo deste trabalho foi realizar uma análise comparativa de três métodos de isolamento de RNA e identificar o protocolo mais adequado para a extração de RNA de qualidade a partir de três tecidos de mandioca: raiz tuberosa, caule e folha. Foram comparados os métodos CTAB (com duas formas de precipitação), TRIzol e Fenol Ácido. Dos três métodos de extração testados neste trabalho, o método CTAB, com otimizações usando precipitação com cloreto de lítio, permitiu o isolamento de RNA de alta qualidade de raiz, caule e folha atendendo aos níveis sugeridos de quantidade e pureza e foi possível obter quantidades suficientes para o desenvolvimento de ensaios moleculares. |
| Abstract: | Cassava (Manihot esculenta Crantz) is considered one of the main agricultural crops, not only in Brazilian territory but also in several other countries. To understand the molecular processes that regulate the development and resistance of cassava to diseases, for example, the use of advanced molecular tools is essential. RNA extraction is a fundamental step in molecular studies. However, the removal process is complex and requires care to avoid degradation of the RNA and ensure sample purity. The objective of this work was to perform a comparative analysis of three RNA isolation methods and identify the most appropriate protocol for extract quality RNA from three cassava tissues: tuberous root, stem and leaf. The CTAB methods (two precipitation way), TRIzol and Acid Phenol were compared. Of the three extraction methods tested in this work, the CTAB method, with optimizations using lithium chloride precipitation, allowed the isolation of high-quality RNA from root, stem and leaf with the suggested levels of quantity and purity and it was sufficient for the development of molecular assays. |
| URI: | http://hdl.handle.net/11612/7609 |
| Aparece nas coleções: | Mestrado em Agroenergia |
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